Pembukaan pendaftaran calon mahasiswa Prodi MMB UPN "Veteran" Yogyakarta dilakukan 2 kali dalam setahun. Pada Semester Ganjil pendaftaran dimulai Bulan Juni dan seleksi diselenggarakan pada Bulan Juli. sedangkan pada semester Genap, Pendaftaran dilakukan pada Bulan Desember dan seleksi akan diselenggarakan Bulan Januari. Calon mahasiswa baru wajib mengikuti tes wawancara yang dilakukan setelah menyerahkan persyaratan pendaftaran. Tes wawancara dilakukan antara calon mahasiswa dengan tim penerimaan mahasiswa baru yang beranggotakan koordinator program studi dan beberapa dosen pengajar. Tes wawancara bertujuan untuk menilai kemampuan akademik yang berupa kecakapan dalam menjawab serta kesanggupan pembayaran SPP selama menempuh jenjang S2. Selain itu, sebelum dilakukan tes wawancara, calon mahasiswa harus membuat rencana penelitian tesis agar di dalam menempuh perkuliahan dapat benar-benar sesuai dengan peminatannya. Adapun persyaratan seperti di bawah ini:
- Bukti pembayaran pendaftaran sebesar Rp. 500.000,00 ke rekening Rektor
- Mengisi formulir pendaftaran
- Pengantar dari pimpinan instansi tempat bekerja , bagi mahasiswa baru yang biaya studi ditanggung oleh instansi.
- Foto copy ijazah dan transkrip sarjana (S-1) yang telah dilegalisir minimal IPK 2,75 masing-masing 2 lembar.
- Surat rekomendasi dari dua orang yang dianggap mampu memberikan kelayakan akademik calon pendaftar
- Surat keterangan resmi dari penyandang dana studi
- Fotocopy KTP yang masih berlaku
- Pas foto ukuran 4 X 6 masing-masing 3 lembar, 3 x 4 (3 lembar), dan 2 x 3 (3 lembar)