Rencana penelitian tesis dan panduan penulisan hasil penelitian tesis yang disosialisasikan dan didistribusikan kepada mahasiswa yang mengambil tesis, dosen penguji, dan tim penjamin mutu tesis. Mahasiswa dalam mengajukan usulan topik tesis dan pembimbing kepada Koordinator Program Studi untuk dipertimbangkan dan disetujui. Koordinator Prodi MMB kemudian akan menentukan kesesuaian judul dengan calon dosen pembimbing.
Proses pembimbingan tesis dilakukan sejak penyusunan rencana penelitian tesis, penyusunan hasil penelitian tesis sampai dengan penyajian hasil penelitian tesis. Sistem pembimbingan penelitian tesis mengacu pada pedoman penulisan tesis dan prosedur pembimbingan tesis yang sudah ada. Dalam penyusunan tesis mahasiswa dibimbing oleh komisi pembimbing yang terdiri dari 2 (dua) pembimbing (pembimbing 1 dan 2) yang telah memenuhi kualifikasi sebagai pembimbing dan sesuai dengan bidang keahlian dan kompetensinya. Proses pembimbingan tesis diupayakan kurang dari 12 bulan.Agar studi dapat diselesaikan tepat waktu maka pelaksanaan kegiatan perlu dijadwal baik untuk perkuliahan maupun dalam proses penyusunan tesis yang dapat dipantau melalui buku bimbingan tesis dan mahasiswa diwajibkan membuat jadwal kegiatan. Pengajuan topik penelitian harus sudah direncanakan sejak awal semester peserta dinyatakan diterima yang kemudian ditindaklanjuti ketika semester 3. Usulan ujian akhir dapat dilakukan apabila tesis sudah disetujui oleh kedua pembimbing serta telah melengkapi semua persyaratan adminstratif. Form pengajuan judul terdapat di lampiran